Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GIMD1P0DJR0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms