Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF1RP07333 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms