Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPAG9O60271 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms