Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HOXA3O43365 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA3O43365 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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