Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPATO15228 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPATO15228 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPATO15228 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GNPATO15228 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPATO15228 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPATO15228 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms