Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CEP290O15078 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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CEP290O15078 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP290O15078 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CEP290O15078 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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CEP290O15078 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CEP290O15078 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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