Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2O14595 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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