Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRTO14522 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRTO14522 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
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