Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE40O14503 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms