Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms