Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9PBE3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E9PBE3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E9PBE3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
E9PBE3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E9PBE3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E9PBE3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E9PBE3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E9PBE3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.8 ms