Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRT4C9JH25 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRRT4C9JH25 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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