Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPBD1B2RD01 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms