Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms