Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms