Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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