Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GY05 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
V9GY05 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GY05 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
V9GY05 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GY05 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms