Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMTA1Q9Y6Y1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMTA1Q9Y6Y1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms