Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUBP2Q9Y5Y2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms