Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms