Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms