Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEMD3Q9Y2U8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms