Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms