Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC12A4Q9UP95 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms