Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2AQ9ULE3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms