Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRTO4Q9UKD2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRTO4Q9UKD2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms