Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GGA1Q9UJY5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms