Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFMBT1Q9UHJ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms