Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5BQ9UGL1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms