Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF2Q9UG63 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF2Q9UG63 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms