Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms