Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC4Q9UBN4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms