Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20BQ9P0W2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20BQ9P0W2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms