Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms