Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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