Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB4Q9NTQ9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms