Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms