Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSU72Q9NP77 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms