Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMURF2Q9HAU4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms