Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXQ1Q9C009 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FOXQ1Q9C009 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXQ1Q9C009 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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