Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP1Q9C000 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms