Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR2Q9BYE9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms