Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5DQ9BY66 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5DQ9BY66 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms