Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL3Q9BXA9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms