Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP2Q9BX26 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP2Q9BX26 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms