Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP3Q9BWW4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3Q9BWW4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms