Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms