Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HIGD2AQ9BW72 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms