Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2AFJQ9BTM1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms