Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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